More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  55.08 
 
 		 658 aa  690    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  66.41 
 
 		 651 aa  845    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  62.92 
 
 		 667 aa  794    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  63.82 
 
 		 642 aa  808    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  58.05 
 
 		 644 aa  726    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  53.57 
 
 		 636 aa  667    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  68.36 
 
 		 634 aa  881    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  100 
 
 		 656 aa  1322    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  58.02 
 
 		 628 aa  724    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  50.69 
 
 		 656 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  51.9 
 
 		 629 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  50.61 
 
 		 629 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  50.98 
 
 		 641 aa  585  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  49.22 
 
 		 652 aa  586  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  48.48 
 
 		 616 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  49.85 
 
 		 623 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  51.42 
 
 		 645 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  49.16 
 
 		 629 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  49.47 
 
 		 616 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  48.78 
 
 		 639 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  48.65 
 
 		 624 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  48.94 
 
 		 657 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  51.13 
 
 		 628 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  47.73 
 
 		 632 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  46.96 
 
 		 639 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  49.11 
 
 		 655 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  47.43 
 
 		 627 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  42.9 
 
 		 699 aa  529  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  47.34 
 
 		 649 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  41.42 
 
 		 718 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  47.96 
 
 		 629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  46.39 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  46.39 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  46.39 
 
 		 640 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  45.62 
 
 		 648 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  46.44 
 
 		 647 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  55.9 
 
 		 700 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  45.08 
 
 		 932 aa  485  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.44 
 
 		 600 aa  287  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  38.29 
 
 		 618 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.42 
 
 		 626 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  33.84 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  38.16 
 
 		 655 aa  276  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.13 
 
 		 595 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.73 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  33.44 
 
 		 626 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  35.73 
 
 		 583 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.32 
 
 		 582 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  38.82 
 
 		 587 aa  266  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  32.56 
 
 		 652 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.56 
 
 		 587 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.25 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.68 
 
 		 604 aa  259  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.24 
 
 		 587 aa  257  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.36 
 
 		 605 aa  256  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.44 
 
 		 613 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.86 
 
 		 619 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  37.88 
 
 		 641 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  37.01 
 
 		 587 aa  253  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  30.28 
 
 		 588 aa  253  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  33.93 
 
 		 642 aa  252  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33.76 
 
 		 601 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.15 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  31.38 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  35.38 
 
 		 592 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  31.86 
 
 		 544 aa  249  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.85 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  37.76 
 
 		 588 aa  248  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  34.33 
 
 		 651 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  33.85 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.63 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.63 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.63 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.44 
 
 		 663 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.63 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.63 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.63 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.25 
 
 		 584 aa  244  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  35.29 
 
 		 605 aa  244  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  33.92 
 
 		 660 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  36.23 
 
 		 694 aa  243  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  33.41 
 
 		 581 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.56 
 
 		 664 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  33.41 
 
 		 581 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  33.98 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  35.94 
 
 		 655 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.48 
 
 		 600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  32.96 
 
 		 582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  34.06 
 
 		 640 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  35.46 
 
 		 682 aa  241  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  37 
 
 		 604 aa  239  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.05 
 
 		 623 aa  239  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  32.8 
 
 		 640 aa  238  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 604 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  32.97 
 
 		 582 aa  238  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  32.51 
 
 		 598 aa  238  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  32.97 
 
 		 582 aa  238  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  32.97 
 
 		 582 aa  238  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>