More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 338 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  49.85 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  48.08 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  48.08 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  47.58 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  47.27 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0852  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.9 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.94 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  39.7 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.59 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  38.92 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  37.16 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  38.17 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 214 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  49.71 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.07 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 234 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.43 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  43.01 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  43.18 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 325 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  32.86 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  41.42 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  40.12 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  41.72 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  45.27 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  33.53 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  45.51 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  38.86 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  41.25 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 310 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  35.47 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  37.09 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>