More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2252 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2252  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 404 aa  843    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  24.51 
 
 		 374 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.81 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.79 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1786  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  20.63 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.93 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  23.65 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.55 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  24.05 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.23 
 
 		 349 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  23.71 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.7 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  21.43 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.46 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  21.45 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  21.94 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  24.6 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  23.45 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  24.64 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  21.98 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.25 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7439  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.62 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  21.92 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1242  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.48 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00350809  normal  0.534968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.02 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  24.32 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.41 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.53 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.35 
 
 		 296 aa  57  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  22.29 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 330 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  22.28 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.92 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  23.1 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  21.43 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.65 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  28.43 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  30.3 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.65 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 327 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.15 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.56 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>