265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2532 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  57.93 
 
 		 732 aa  815    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  55.83 
 
 		 674 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  55.18 
 
 		 734 aa  773    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  57.62 
 
 		 709 aa  785    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  57.43 
 
 		 730 aa  818    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  53.78 
 
 		 667 aa  739    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  55.18 
 
 		 734 aa  771    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  54.65 
 
 		 739 aa  763    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  52.96 
 
 		 689 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  57.6 
 
 		 715 aa  806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  57.89 
 
 		 715 aa  810    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 691 aa  1418    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  54.2 
 
 		 680 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  57.46 
 
 		 715 aa  805    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  56.62 
 
 		 707 aa  776    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  50.15 
 
 		 689 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  54.65 
 
 		 739 aa  763    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  36.48 
 
 		 754 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  37.32 
 
 		 667 aa  362  9e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  33.17 
 
 		 641 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  34.16 
 
 		 668 aa  346  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.89 
 
 		 661 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  30.65 
 
 		 683 aa  332  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  32.97 
 
 		 669 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  35.92 
 
 		 662 aa  331  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  32.75 
 
 		 660 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  31.69 
 
 		 662 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  30.87 
 
 		 653 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  30.99 
 
 		 681 aa  312  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  34.32 
 
 		 676 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 		 656 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  32.89 
 
 		 645 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  34.24 
 
 		 767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  32.42 
 
 		 671 aa  302  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  34.26 
 
 		 674 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  34.26 
 
 		 674 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  30.01 
 
 		 696 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  33.61 
 
 		 767 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  33.39 
 
 		 687 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  29.28 
 
 		 705 aa  271  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  30.78 
 
 		 645 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  30.72 
 
 		 672 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  28.77 
 
 		 680 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  30 
 
 		 698 aa  241  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  28.18 
 
 		 688 aa  240  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  27.89 
 
 		 688 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  30.31 
 
 		 673 aa  234  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  29.74 
 
 		 635 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  28.69 
 
 		 689 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  28.62 
 
 		 662 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  29.75 
 
 		 676 aa  225  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  30.87 
 
 		 649 aa  225  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  29.76 
 
 		 684 aa  224  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  34.28 
 
 		 943 aa  220  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  27.21 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  27.26 
 
 		 662 aa  214  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  30.54 
 
 		 668 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  29.29 
 
 		 685 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  29.29 
 
 		 685 aa  201  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  28.86 
 
 		 726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  30.91 
 
 		 706 aa  189  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  28.44 
 
 		 685 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  25.39 
 
 		 692 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  25.17 
 
 		 634 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  25.93 
 
 		 633 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 		 632 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  27.22 
 
 		 644 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  30.29 
 
 		 632 aa  144  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.93 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  23.45 
 
 		 631 aa  131  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  21.99 
 
 		 637 aa  130  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  26.04 
 
 		 634 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  31.45 
 
 		 737 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  25.97 
 
 		 644 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  29.05 
 
 		 862 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  23.33 
 
 		 744 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  28.81 
 
 		 760 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  23.13 
 
 		 730 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  36.65 
 
 		 790 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  23.66 
 
 		 742 aa  104  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  24.71 
 
 		 681 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  38.76 
 
 		 800 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  23.66 
 
 		 742 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  23.15 
 
 		 635 aa  101  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  23.32 
 
 		 742 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  23.49 
 
 		 742 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  23.49 
 
 		 742 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  22.74 
 
 		 742 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  25.05 
 
 		 728 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  26.58 
 
 		 788 aa  95.5  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  22.67 
 
 		 742 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  32.95 
 
 		 815 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  24.69 
 
 		 764 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  24.16 
 
 		 768 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  22.66 
 
 		 742 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  43.43 
 
 		 800 aa  90.5  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  23.83 
 
 		 742 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  36.3 
 
 		 806 aa  90.5  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 		 825 aa  90.5  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  26.55 
 
 		 769 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>