More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0137 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
577 aa  1162    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  57.66 
 
 
580 aa  676    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  58.33 
 
 
578 aa  685    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  55.02 
 
 
569 aa  608  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  50.43 
 
 
570 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  49.74 
 
 
570 aa  528  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  50.26 
 
 
570 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  48.95 
 
 
570 aa  501  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  44.07 
 
 
617 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  37.02 
 
 
662 aa  153  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 
725 aa  143  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  35.37 
 
 
656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  34.48 
 
 
478 aa  140  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  34.5 
 
 
450 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  34.51 
 
 
450 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
656 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  33.72 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  32.79 
 
 
657 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  33.2 
 
 
653 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  36.89 
 
 
466 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  32.93 
 
 
619 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
665 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 
434 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  31.3 
 
 
639 aa  130  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  26.74 
 
 
432 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  32.82 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  33.74 
 
 
697 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 
744 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  34.8 
 
 
305 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  29.37 
 
 
749 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 
1085 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  30.68 
 
 
634 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  32.66 
 
 
448 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  32.22 
 
 
652 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  31.65 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  32.46 
 
 
697 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  33.48 
 
 
444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  38.29 
 
 
445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  35.9 
 
 
459 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  33.33 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 
1193 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 
711 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  31.91 
 
 
443 aa  110  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  29.08 
 
 
689 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  29.22 
 
 
743 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  32.48 
 
 
698 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.71 
 
 
391 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  36.32 
 
 
450 aa  108  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  30.55 
 
 
387 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  30.04 
 
 
787 aa  107  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 
788 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  28.31 
 
 
622 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  36.6 
 
 
367 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  34.2 
 
 
228 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 
680 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  32.29 
 
 
352 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  31.84 
 
 
369 aa  102  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  30.74 
 
 
646 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  28.71 
 
 
493 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  34.05 
 
 
678 aa  97.8  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  40.94 
 
 
676 aa  97.1  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  34.2 
 
 
773 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  36.73 
 
 
795 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  31.96 
 
 
771 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.26 
 
 
801 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  29.49 
 
 
671 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  33.77 
 
 
773 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  38.79 
 
 
672 aa  95.1  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  36.88 
 
 
772 aa  95.1  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  35.06 
 
 
682 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  30.17 
 
 
766 aa  94  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  39.61 
 
 
655 aa  94  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  26.62 
 
 
632 aa  93.6  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.18 
 
 
756 aa  93.6  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  35.03 
 
 
680 aa  93.6  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  31.3 
 
 
639 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.75 
 
 
718 aa  92.8  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  29.87 
 
 
393 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.9 
 
 
739 aa  92.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.17 
 
 
732 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  35.26 
 
 
680 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 
239 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  29.72 
 
 
337 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  30.73 
 
 
699 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  36.18 
 
 
771 aa  91.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  33.06 
 
 
477 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.64 
 
 
510 aa  91.3  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  38.12 
 
 
668 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.83 
 
 
735 aa  90.9  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  34.84 
 
 
725 aa  90.9  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  27.83 
 
 
402 aa  90.9  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  28.46 
 
 
630 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.74 
 
 
738 aa  90.5  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  28.51 
 
 
417 aa  90.5  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  29.75 
 
 
413 aa  90.5  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 
677 aa  90.1  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  28.44 
 
 
389 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  28.44 
 
 
713 aa  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>