50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0287 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  100 
 
 		 714 aa  1481    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  37.15 
 
 		 701 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.21 
 
 		 865 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  21.93 
 
 		 860 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.58 
 
 		 906 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  22.01 
 
 		 859 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  22.24 
 
 		 859 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 865 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  21.28 
 
 		 772 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  23.43 
 
 		 874 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 875 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  21.09 
 
 		 872 aa  77.4  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  20.81 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 792 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  20.53 
 
 		 831 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 790 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  22.44 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  29.41 
 
 		 780 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  23 
 
 		 888 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 881 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  23.1 
 
 		 800 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  22.22 
 
 		 821 aa  53.9  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 791 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 793 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 772 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  29.61 
 
 		 791 aa  50.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25 
 
 		 663 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 803 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  21.72 
 
 		 786 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 775 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 775 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 791 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  23.72 
 
 		 821 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.84 
 
 		 666 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.26 
 
 		 666 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.09 
 
 		 666 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 897 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.26 
 
 		 666 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.26 
 
 		 666 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  20.54 
 
 		 756 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.26 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 649 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 753 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 792 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  20.9 
 
 		 800 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 787 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 814 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 814 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 804 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  20.37 
 
 		 789 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>