More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4399 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.62 
 
 
367 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  34.27 
 
 
342 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  30.72 
 
 
318 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  32.04 
 
 
321 aa  136  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  30.94 
 
 
330 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  30.38 
 
 
321 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  30.81 
 
 
326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  30.57 
 
 
334 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.79 
 
 
355 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.19 
 
 
320 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  29.43 
 
 
371 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  29.6 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  29.6 
 
 
358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  29.89 
 
 
369 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  29.89 
 
 
358 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  30.88 
 
 
331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  28.98 
 
 
358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  28.98 
 
 
350 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  27.87 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27.87 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  27.87 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  27.87 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  27.87 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  27.87 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  30.52 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  27.87 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  28.57 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  29.28 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  32.07 
 
 
324 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  32.41 
 
 
345 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  28.57 
 
 
361 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  28.71 
 
 
353 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  28.71 
 
 
353 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  28.71 
 
 
357 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  28.42 
 
 
369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  26.75 
 
 
358 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  31.27 
 
 
337 aa  99.4  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.8 
 
 
240 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  33.97 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  26.37 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  30.18 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 
264 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
239 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 
224 aa  92.8  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.63 
 
 
319 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.88 
 
 
350 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  30.86 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.88 
 
 
350 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 
237 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  42.72 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.18 
 
 
230 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  40.15 
 
 
228 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 
228 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 
228 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
239 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
223 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  27.02 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.12 
 
 
351 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
218 aa  89  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 
296 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  41.75 
 
 
319 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.28 
 
 
209 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  48.54 
 
 
210 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.5 
 
 
447 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 
224 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  48.54 
 
 
210 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  43.52 
 
 
225 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 
205 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
215 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  39.47 
 
 
218 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 
230 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  43.81 
 
 
415 aa  86.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.89 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  52.63 
 
 
233 aa  86.3  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 
261 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 
227 aa  86.3  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 
222 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
230 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.92 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
230 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  44.23 
 
 
222 aa  85.9  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  40 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  32.56 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  50 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  45.98 
 
 
727 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.82 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  37.8 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  32.89 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  29.25 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  41.51 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
189 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>