194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1469 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1469  luciferase-like  100 
 
 		 384 aa  805    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1971  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.97 
 
 		 416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  27.14 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.48 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  23.24 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.88 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  26.34 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  25.62 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  23.75 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  25.12 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  23.04 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  29.27 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  23.47 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  24.07 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  26.06 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  25.47 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  26.26 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.85 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  23.04 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  22.4 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  22.71 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  21.43 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.21 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  28.22 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  22.68 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  28 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  24.11 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  24.11 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  21.91 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.47 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  23.46 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  23.54 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  22.01 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  23.54 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  23.54 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  22.03 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  25.49 
 
 		 439 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  26 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  25.2 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  23.46 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  21.9 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  25.49 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  23.15 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  21.43 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  25.91 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  23.54 
 
 		 346 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  33.7 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  24.62 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  25.85 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  21.51 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  22.5 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 		 375 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  22.03 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25.12 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  23.22 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  22.13 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  22.27 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2757  alkanesulfonate monooxygenase  24.93 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0174174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  19.26 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  24.36 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  24.36 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  34.74 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  30.77 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  30.21 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  31.79 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.57 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  22.12 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  31.87 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  22.12 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  23.66 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1286  luciferase family oxidoreductase, group 1  28.57 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0281951  normal  0.0214125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.21 
 
 		 322 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.26 
 
 		 352 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  33.67 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  34.12 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  23.08 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  23.06 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  22.27 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  21.68 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  33.33 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.39 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  23.5 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  22.66 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  23.89 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  23.22 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  32.82 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  22.69 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  21.24 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  22.96 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  22.02 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.39 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  21.15 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  22.96 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  22.96 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  26.09 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  20.06 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  20.97 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>