More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0973 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  50.55 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 193 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  51.75 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 186 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.21 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  29.08 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  30.49 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  30 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
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