More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0707 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 		 341 aa  700    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  41.11 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  39.13 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  42.52 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  40.91 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  40.9 
 
 		 347 aa  222  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  38.08 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  40 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  37.35 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  39.15 
 
 		 350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  40 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  37.78 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  36.5 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.26 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  36.1 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  35.61 
 
 		 356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  40.62 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  33.43 
 
 		 353 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  37.32 
 
 		 347 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  35.36 
 
 		 349 aa  192  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  35 
 
 		 350 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  36.1 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.2 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  35.99 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  34.1 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  35.71 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  35.03 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.06 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  31.01 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  33.15 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  32.6 
 
 		 361 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  31.69 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  34.6 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.94 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.64 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.75 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  35.28 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.21 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  34.39 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.47 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  32.47 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  33.33 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  29.41 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  33.14 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  31.76 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  32.75 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  33.05 
 
 		 359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  30.51 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  30.68 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.41 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.1 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  29.25 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.85 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.49 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  32.49 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.49 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  32 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  31.73 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  31.91 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  31.05 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  30.79 
 
 		 354 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  30.08 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.2 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  27.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  30.06 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  36.71 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.17 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.26 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  30.23 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  37.99 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  30.03 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  28.89 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.41 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  30.43 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  29.18 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  38.1 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.79 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.84 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.25 
 
 		 355 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.99 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.06 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.41 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.61 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.47 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.58 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.97 
 
 		 406 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.21 
 
 		 367 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 		 364 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  32.77 
 
 		 492 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  33.96 
 
 		 349 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.14 
 
 		 370 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  33.33 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>