More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2113 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  100 
 
 		 509 aa  971    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  52.59 
 
 		 528 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  50.1 
 
 		 526 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  51.08 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  53.29 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  52.23 
 
 		 536 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  53.15 
 
 		 517 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 521 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  52.39 
 
 		 558 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  53.6 
 
 		 481 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 		 562 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 575 aa  363  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 541 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 		 506 aa  355  8.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 528 aa  353  4e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  42.83 
 
 		 509 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  44.4 
 
 		 514 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 540 aa  352  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 535 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  49.2 
 
 		 528 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  46.14 
 
 		 588 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 		 539 aa  349  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  43.48 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 584 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  51.93 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  45.45 
 
 		 554 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  49.39 
 
 		 477 aa  332  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 525 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  43.15 
 
 		 525 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 525 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.08 
 
 		 537 aa  310  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 532 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 563 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 533 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 513 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 		 513 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 521 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  44.23 
 
 		 535 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 		 508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 		 524 aa  269  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 511 aa  263  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  37.45 
 
 		 492 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 503 aa  259  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  39.07 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  35.44 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  39.83 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 514 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  37.7 
 
 		 516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.68 
 
 		 525 aa  226  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  35.4 
 
 		 513 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 504 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 		 534 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 501 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 594 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  33.27 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 520 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 503 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  38.09 
 
 		 528 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.27 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 		 532 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.92 
 
 		 626 aa  210  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.68 
 
 		 520 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 523 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 519 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 607 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  35.46 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  36.43 
 
 		 501 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 501 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  33.26 
 
 		 495 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>