More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1716 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.31 
 
 		 1028 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  41.53 
 
 		 1029 aa  759    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  40.98 
 
 		 1019 aa  795    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  100 
 
 		 1014 aa  2026    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  43.24 
 
 		 1036 aa  821    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  43.29 
 
 		 1040 aa  852    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  43.34 
 
 		 1013 aa  792    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  41.2 
 
 		 1041 aa  733    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1019 aa  788    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  43.54 
 
 		 1036 aa  835    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  41.81 
 
 		 1021 aa  798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  38.98 
 
 		 1015 aa  727    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  50.89 
 
 		 1017 aa  957    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1025 aa  779    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  42.53 
 
 		 1025 aa  832    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.11 
 
 		 1013 aa  696    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  45.16 
 
 		 1010 aa  861    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  43.66 
 
 		 1019 aa  842    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  40.91 
 
 		 1016 aa  727    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  44.02 
 
 		 1032 aa  823    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  42.03 
 
 		 1028 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  41.43 
 
 		 1029 aa  761    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.49 
 
 		 1028 aa  828    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  41.53 
 
 		 1029 aa  761    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  41.8 
 
 		 1014 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  41.7 
 
 		 1029 aa  760    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.22 
 
 		 1028 aa  701    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1028 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  70.62 
 
 		 1016 aa  1474    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  41.1 
 
 		 1023 aa  791    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  41.54 
 
 		 1025 aa  770    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  41.64 
 
 		 1028 aa  773    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  42.21 
 
 		 1016 aa  744    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  40.96 
 
 		 1024 aa  762    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  42.55 
 
 		 1027 aa  771    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  36.97 
 
 		 1035 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  38.14 
 
 		 1012 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  42.73 
 
 		 1029 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  42.73 
 
 		 1029 aa  762    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  36.97 
 
 		 1035 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  41.4 
 
 		 1013 aa  738    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  41.73 
 
 		 1021 aa  771    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 		 1029 aa  807    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  44.29 
 
 		 1009 aa  857    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  39.96 
 
 		 1020 aa  740    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  42.84 
 
 		 1043 aa  761    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  35.53 
 
 		 1020 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  36.85 
 
 		 1027 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  60.75 
 
 		 1017 aa  1141    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  42.16 
 
 		 1056 aa  805    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  41.45 
 
 		 1024 aa  764    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  42.52 
 
 		 1027 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  36.87 
 
 		 1035 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.46 
 
 		 1033 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1033 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.75 
 
 		 1027 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1022 aa  562  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1019 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1021 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1017 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  33.07 
 
 		 1025 aa  548  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1053 aa  549  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 		 1017 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  33.13 
 
 		 1036 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.32 
 
 		 1019 aa  542  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1046 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1020 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1047 aa  542  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1046 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  32.51 
 
 		 1046 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1039 aa  535  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  32.74 
 
 		 1046 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1050 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1039 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  32.32 
 
 		 1015 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1031 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  31.22 
 
 		 1047 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1044 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1049 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  32.32 
 
 		 1015 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1023 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1560  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1026 aa  528  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.701497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1036 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1048 aa  529  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 		 1049 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 		 1045 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1054 aa  526  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.49 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1017 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1031 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  30.81 
 
 		 1040 aa  522  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1019 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1029 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  31.63 
 
 		 1024 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1012 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1041 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 		 1029 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1051 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0734  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1035 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  31.72 
 
 		 1024 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>