135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2834 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  57.66 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  36.56 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  36.56 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  35.78 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  47.24 
 
 		 375 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  44.7 
 
 		 301 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  44.7 
 
 		 301 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  44.36 
 
 		 301 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  40.12 
 
 		 179 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  45.32 
 
 		 429 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  45.16 
 
 		 496 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  42.42 
 
 		 365 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  43.18 
 
 		 446 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  44.35 
 
 		 476 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  45.67 
 
 		 472 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  42.74 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  45.16 
 
 		 474 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  43.88 
 
 		 429 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  42.52 
 
 		 460 aa  101  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  36.25 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  43.18 
 
 		 404 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  42.52 
 
 		 466 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  41.73 
 
 		 391 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  40.27 
 
 		 433 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  42.22 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  42.06 
 
 		 410 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  39.37 
 
 		 402 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  39.37 
 
 		 409 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  41.73 
 
 		 432 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  39.57 
 
 		 377 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  36.18 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  36.8 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  37.5 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  39.68 
 
 		 383 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  39.06 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  36.84 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  32.68 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  39.37 
 
 		 412 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  37.21 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  36.43 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  30.39 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  32.37 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  37.3 
 
 		 380 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  40.16 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  25.33 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  35.38 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  25.33 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  36.36 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  34.33 
 
 		 153 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  41.67 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  35.24 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  38.38 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  36.84 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  35.71 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  39.36 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  35.16 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  35.71 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  38.3 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  36.44 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  35.29 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  32.87 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  33.58 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  37.7 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  42.71 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  38.02 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  34.75 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  34.88 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  37.25 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  33.59 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  28.65 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  34.71 
 
 		 546 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  40.21 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  35 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  36.13 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  35.48 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  33.88 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  38.52 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.67 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.67 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.88 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  33.88 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  31.67 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  38.14 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.88 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.45 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 		 400 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  43.55 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.67 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.67 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  34.4 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  37.62 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  37.76 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  33.61 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  32.61 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  35.2 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  30.65 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  30.89 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  33.61 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>