215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2530 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2530  putative FecR  100 
 
 		 329 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2599  putative FecR  33.7 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5188  putative FecR  30.28 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  32.27 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.8 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  28.9 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  27.39 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  27.8 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  27.08 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  28.66 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  28.05 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  25.94 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  28.05 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  27.27 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  28.66 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  24.79 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  27.44 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  24.28 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  26.74 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  25.39 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  24.85 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  26.59 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  27.08 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  28.76 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  26.26 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  24.39 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  26.28 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  27.67 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  26.33 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  26.91 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  26.55 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  27.18 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  27.18 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  29.36 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  27.4 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  26.05 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  29 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  28.29 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  29.9 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.74 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  29.85 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  28.08 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  28.01 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  28.85 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  25.23 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  25.32 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  26.95 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  26.32 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  25.76 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  30.21 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  25.54 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  30.1 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  25.3 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  34.62 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  25.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  26.05 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  25.8 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  29.03 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  26.86 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  31 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  28.57 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  26.4 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  27.71 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  35.33 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  25.4 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  25.8 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  23.01 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  29.06 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  27.01 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  25.18 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  28.4 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  26.79 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  26.06 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  24.84 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  29.29 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  24.61 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  29.29 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  27.56 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  28.08 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  25.5 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  26.39 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  24.92 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  29.17 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  26.03 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  23.15 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  24.06 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  28.87 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  28.49 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  26.8 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  26.39 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>