104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1845 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 422 aa  856    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  30.77 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  28.37 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  28.37 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  28.38 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  28.19 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  28.68 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  29.77 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  28.37 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  28.99 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  27.22 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  27.55 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  27.55 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  27.3 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  27.88 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  29.86 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  28.93 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  27.99 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  28.18 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  26.45 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  27.06 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  27.06 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  27.99 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  28.18 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  27.91 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  27.23 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  26.98 
 
 		 372 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  26.79 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  26.79 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  26.79 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  26.79 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  27.3 
 
 		 376 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  26.56 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  26.53 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  26.44 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  24.61 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  25.82 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  24.34 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  25.07 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  25.14 
 
 		 382 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  27.78 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  24.73 
 
 		 367 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  23.45 
 
 		 391 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  28.8 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  26.88 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  27.03 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  25.2 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.3 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  24.08 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  25.25 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  23.99 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  28.22 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  23.2 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  23.2 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  23.2 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  25.29 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.75 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  23.93 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  22.22 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  23.34 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  26.34 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  23.45 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  21.61 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 		 456 aa  67  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  24.86 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  22.75 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08982  hypothetical fructosyl amine:oxygen oxidoreductase (Eurofung)  22.43 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  22.66 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  23.7 
 
 		 363 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  20.63 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  23.7 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00220  fructosyl amino acid oxidase, putative  23.87 
 
 		 477 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.113312  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10768  conserved hypothetical protein  34.92 
 
 		 255 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0104638 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.67 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>