95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1446 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  100 
 
 		 448 aa  852    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  26.33 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  26.93 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  30.28 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.37 
 
 		 453 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 461 aa  86.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.56 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  27.19 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.33 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  26.68 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  27.54 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.53 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.25 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.33 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  28.61 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.93 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.65 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  20.36 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  35.96 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  23.45 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  21.84 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  28.06 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  36.11 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  25.77 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.49 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  27.44 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  26.91 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  34.48 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  27.54 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  28.37 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  23.5 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.17 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.08 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  33.33 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.08 
 
 		 474 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.08 
 
 		 474 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  21.98 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  34.48 
 
 		 448 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  34.48 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.88 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.738547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.2 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.19 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  33.08 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  28.69 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  23.64 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.74 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.26 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.27 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  45.9 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.93 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  27.66 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  27.25 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  35.07 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.11 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  25.68 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.11 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  24.94 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0696  sugar transporter, putative  29.55 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  20.72 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.53 
 
 		 477 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2259  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.394586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.41 
 
 		 497 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.74 
 
 		 544 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.62 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.29 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  35.82 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  35.82 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  35.82 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  35.82 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  35.82 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.62 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  18.56 
 
 		 454 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>