More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0735 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0735  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
145 aa  285  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 
145 aa  105  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.58 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  34.09 
 
 
214 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.77 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.16 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.16 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.16 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3344  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
332 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.07 
 
 
255 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.64 
 
 
206 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
221 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.11 
 
 
235 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.08 
 
 
218 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.77 
 
 
217 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.77 
 
 
217 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.99 
 
 
215 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
232 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.26 
 
 
233 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.26 
 
 
233 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.26 
 
 
233 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
223 aa  57.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.34 
 
 
230 aa  57.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 
208 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.01 
 
 
218 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.96 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.25 
 
 
238 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.63 
 
 
227 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.63 
 
 
227 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  39.39 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
209 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.51 
 
 
195 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.25 
 
 
238 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.18 
 
 
251 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.18 
 
 
339 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 
223 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.04 
 
 
232 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.72 
 
 
215 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 
215 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.19 
 
 
273 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.93 
 
 
253 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  35 
 
 
227 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
245 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  38.46 
 
 
275 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.37 
 
 
230 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.37 
 
 
230 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.56 
 
 
223 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.56 
 
 
223 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 
207 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  34.78 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.15 
 
 
218 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.53 
 
 
210 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.18 
 
 
277 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0768  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.23 
 
 
234 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
234 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.71 
 
 
279 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0919  ExbBTolQ family transport protein  38.38 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.014762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.15 
 
 
218 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  34.15 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1023  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  34.12 
 
 
224 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.96 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  34.12 
 
 
224 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.75 
 
 
268 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.25 
 
 
209 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.67 
 
 
655 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 
208 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.94 
 
 
220 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  32.93 
 
 
470 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.06 
 
 
224 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 
449 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  34.15 
 
 
220 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.93 
 
 
214 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 
247 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.15 
 
 
220 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.25 
 
 
244 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
240 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.34 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.08 
 
 
147 aa  50.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.16 
 
 
228 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.33 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.33 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.5 
 
 
234 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  39.39 
 
 
220 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 
478 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  33.33 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.9 
 
 
225 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  28.33 
 
 
223 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.9 
 
 
225 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.03 
 
 
555 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  33.75 
 
 
235 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.19 
 
 
227 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  34.57 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.23 
 
 
307 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.77 
 
 
224 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  30.23 
 
 
301 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.371589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>