More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0807 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.41 
 
 
241 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0016  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.22 
 
 
249 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.23 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.92 
 
 
262 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.47 
 
 
303 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.69 
 
 
311 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.96 
 
 
301 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.16 
 
 
286 aa  205  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.93 
 
 
301 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.51 
 
 
303 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.51 
 
 
303 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.73 
 
 
304 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  47.22 
 
 
307 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.03 
 
 
278 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.23 
 
 
301 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.54 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.2 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  46.73 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.38 
 
 
263 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.58 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.54 
 
 
355 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.36 
 
 
240 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  42.79 
 
 
242 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.33 
 
 
242 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.33 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 
242 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.36 
 
 
243 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.67 
 
 
242 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.67 
 
 
242 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.32 
 
 
249 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.32 
 
 
249 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  36.84 
 
 
262 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.57 
 
 
238 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.67 
 
 
238 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.67 
 
 
238 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
300 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
243 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.78 
 
 
230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.45 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.17 
 
 
239 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.81 
 
 
243 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.81 
 
 
243 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
242 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 
250 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 
244 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.15 
 
 
243 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 
244 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 
244 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.05 
 
 
238 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.38 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.05 
 
 
234 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  35.56 
 
 
243 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.25 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  37.85 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.6 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.38 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  34.25 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.57 
 
 
246 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.16 
 
 
250 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 
222 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.99 
 
 
222 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.45 
 
 
253 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.99 
 
 
222 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 
247 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
254 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.52 
 
 
222 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40 
 
 
236 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.75 
 
 
201 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.50819  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 
244 aa  122  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.05 
 
 
222 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 
222 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 
222 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3269  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
222 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  37.17 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  37.76 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3921  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.97 
 
 
255 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.13 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.99 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.59 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  37.24 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.34 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.34 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.86 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  37.24 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.59 
 
 
234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.76 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
230 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  37 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>