More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2088 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
355 aa  691    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.09 
 
 
301 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  66.98 
 
 
307 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  62.39 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.44 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.06 
 
 
304 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.71 
 
 
262 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.3 
 
 
309 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.67 
 
 
303 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.7 
 
 
307 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.55 
 
 
301 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.08 
 
 
303 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.08 
 
 
303 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.72 
 
 
263 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.28 
 
 
286 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.85 
 
 
301 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.22 
 
 
265 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.21 
 
 
299 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.63 
 
 
278 aa  248  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.42 
 
 
241 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.92 
 
 
300 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.54 
 
 
246 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 
238 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 
238 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.09 
 
 
242 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 
238 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.81 
 
 
243 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 
240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.49 
 
 
238 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.44 
 
 
239 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.89 
 
 
238 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.25 
 
 
242 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 
243 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.25 
 
 
242 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.84 
 
 
244 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.84 
 
 
244 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.84 
 
 
244 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 
242 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 
243 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44 
 
 
243 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 
243 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 
243 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.56 
 
 
242 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.56 
 
 
242 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.56 
 
 
242 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.56 
 
 
242 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 
243 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.56 
 
 
242 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  44.39 
 
 
242 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.56 
 
 
242 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 
242 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0016  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.83 
 
 
249 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.98 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.78 
 
 
233 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.04 
 
 
234 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  47.25 
 
 
243 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.41 
 
 
249 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.41 
 
 
249 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  42.79 
 
 
262 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.81 
 
 
230 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 
237 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 
250 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
246 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.48 
 
 
253 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.36 
 
 
201 aa  159  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.50819  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 
247 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.35 
 
 
247 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 
254 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  41.51 
 
 
254 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.86 
 
 
250 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.52 
 
 
238 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  40.1 
 
 
253 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 
222 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.84 
 
 
253 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.1 
 
 
238 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.11 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
250 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.23 
 
 
238 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0756  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 
217 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.41 
 
 
266 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
238 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.57 
 
 
236 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 
222 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.32 
 
 
233 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.61 
 
 
244 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.57 
 
 
237 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.32 
 
 
214 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.44 
 
 
222 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.44 
 
 
222 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0220  putative transport-related membrane protein  36.45 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.3 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.91 
 
 
222 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.53 
 
 
235 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.53 
 
 
235 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.53 
 
 
235 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.53 
 
 
235 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.97 
 
 
222 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.53 
 
 
235 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.97 
 
 
222 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>