More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0919 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0919  ExbBTolQ family transport protein  100 
 
 
155 aa  312  9.999999999999999e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.014762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  93.28 
 
 
135 aa  254  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1523  ExbBTolQ family transport protein  71.33 
 
 
199 aa  210  5.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000117252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0689  ExbBTolQ family transport protein  66.89 
 
 
192 aa  209  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.48 
 
 
195 aa  180  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0144  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  54.79 
 
 
184 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000207566  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0116  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  54.79 
 
 
184 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000187763  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0197  TonB system transport protein ExbB  55.41 
 
 
186 aa  157  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000967122  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0104  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  54.11 
 
 
184 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.32 
 
 
188 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.55 
 
 
231 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.14 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  40.57 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  45.45 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  44.79 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  35.71 
 
 
248 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  41.49 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  36.67 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.24 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.5 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  35.66 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  45.45 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  45.45 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  35.06 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  32.45 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  45.45 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.3 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  45.45 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.68 
 
 
232 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
231 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  43.53 
 
 
234 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.53 
 
 
233 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  35.07 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  41.76 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1850  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 
225 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.83962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  47.95 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  32.62 
 
 
323 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  36.8 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  36.8 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  39.45 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 
229 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  45.24 
 
 
232 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.43 
 
 
229 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  32.67 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  44.16 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  44.16 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  31.79 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  31.79 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.79 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 
221 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  31.79 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  31.79 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.79 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  32.67 
 
 
225 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  37.9 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  39.32 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  40.86 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  45 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  47.83 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  31.79 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  43.21 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.37 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  37.07 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  40.95 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.69 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  31.79 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  39.05 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.94 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  38.81 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.27 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  54.84 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  43.18 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  40.43 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.38 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.79 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  32 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  37.61 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.05 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  37.61 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.79 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  31.91 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  37.61 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.72 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  44.44 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.18 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  38.18 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  38.18 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>