More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4039 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  95 
 
 		 206 aa  393  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  94 
 
 		 210 aa  390  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  92.23 
 
 		 203 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  75.5 
 
 		 204 aa  323  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  75 
 
 		 204 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  75.5 
 
 		 204 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  75.5 
 
 		 204 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  75 
 
 		 204 aa  317  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  57.44 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  53.93 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  40.59 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  40.21 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  40.49 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  39.11 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  38.55 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  34.24 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  36.25 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  42.95 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  37.06 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  37.06 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.23 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  38.98 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  36.52 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.03 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  35.36 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  34.81 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  38.99 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  34.81 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.23 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  36.14 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  33.73 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  30.46 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  31.65 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  24.76 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  26.21 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  25.6 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.95 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  26.02 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  30.99 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  27.66 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  30.99 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.56 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  30.52 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  27.62 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.92 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.1 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  27.96 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.74 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.54 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.59 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  25.95 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  32.57 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  26.09 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  22.35 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  32.57 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  30.9 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.53 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.45426  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  28.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>