147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0619 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  91.03 
 
 		 223 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  90.58 
 
 		 223 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  60.27 
 
 		 233 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  53.15 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  54.22 
 
 		 224 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  52.04 
 
 		 220 aa  211  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  35.44 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  36 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  33.8 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  34.78 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  34.07 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  34.07 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  32.89 
 
 		 264 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  32.3 
 
 		 233 aa  104  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  39.07 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  34.85 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  32.88 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  35.74 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  31.74 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  30.77 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  33.91 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  33.48 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  32.49 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  34.6 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  34.21 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  34.45 
 
 		 250 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  32.49 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  34.33 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  35.68 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  35.56 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.22 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  33.33 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  32.89 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  32.61 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  35.68 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  34.93 
 
 		 281 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  31.1 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  32.46 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  33.74 
 
 		 259 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  32.02 
 
 		 269 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  30.45 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  34.76 
 
 		 287 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  29.54 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  30.66 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  32.58 
 
 		 237 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  31.16 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  34.86 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  27.23 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  35.38 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  29.28 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  33.48 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  30.17 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  30.67 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  29.46 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  28.28 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.39 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  32.86 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  25.5 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  30.28 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  29.95 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  29.74 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  24.38 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  31.39 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.57 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  29.44 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  29.63 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  27.05 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.25 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  28.97 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  24.65 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.25 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.56 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  32.73 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  30.49 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  27.68 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  27.8 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.25 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  29.71 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  28.17 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  34.02 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  27.68 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  34.68 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  28.69 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  32.19 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.1 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  28.1 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  32.99 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.5 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.96 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  28.64 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28.1 
 
 		 342 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.39 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.5 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  25.96 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  28.71 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>