More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2340 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 603 aa  1172    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  62.47 
 
 		 596 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  48.91 
 
 		 611 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  41.98 
 
 		 597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  45.97 
 
 		 598 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.32 
 
 		 612 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 606 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  42.81 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 578 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 859 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.95 
 
 		 605 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  35.65 
 
 		 590 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  38.51 
 
 		 624 aa  353  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  36.93 
 
 		 619 aa  336  9e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.17 
 
 		 618 aa  335  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.3 
 
 		 592 aa  332  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  39.17 
 
 		 593 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.22 
 
 		 597 aa  327  4.0000000000000003e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.09 
 
 		 573 aa  320  3.9999999999999996e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  39.97 
 
 		 608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  39.03 
 
 		 600 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  35.95 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.94 
 
 		 589 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  42.18 
 
 		 598 aa  318  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.27 
 
 		 584 aa  317  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  34.76 
 
 		 602 aa  317  6e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.45 
 
 		 597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.79 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 		 618 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.79 
 
 		 580 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  37.69 
 
 		 609 aa  309  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  36.64 
 
 		 600 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.59 
 
 		 604 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.68 
 
 		 611 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.77 
 
 		 587 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.77 
 
 		 587 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.37 
 
 		 596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  41.45 
 
 		 606 aa  303  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  30.92 
 
 		 599 aa  303  8.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.35 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 575 aa  300  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.02 
 
 		 1091 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  32.8 
 
 		 593 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.27 
 
 		 576 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.59 
 
 		 583 aa  290  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.21 
 
 		 599 aa  289  9e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.39 
 
 		 581 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.28 
 
 		 595 aa  287  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.34 
 
 		 593 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.22 
 
 		 608 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.82 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  36.92 
 
 		 649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.43 
 
 		 627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.57 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.85 
 
 		 590 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.85 
 
 		 590 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  34.15 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  28.85 
 
 		 573 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  39.34 
 
 		 596 aa  279  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  28.8 
 
 		 573 aa  277  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  41.23 
 
 		 597 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  36.22 
 
 		 577 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  39.02 
 
 		 607 aa  277  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.66 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.81 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.95 
 
 		 608 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.51 
 
 		 598 aa  273  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.49 
 
 		 571 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.49 
 
 		 571 aa  273  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.49 
 
 		 571 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.01 
 
 		 582 aa  273  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.51 
 
 		 571 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.67 
 
 		 571 aa  273  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  37.04 
 
 		 592 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 		 571 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.31 
 
 		 565 aa  272  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  35.8 
 
 		 577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.76 
 
 		 637 aa  271  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.75 
 
 		 596 aa  271  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  32.5 
 
 		 1194 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.75 
 
 		 581 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.36 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  33.9 
 
 		 581 aa  270  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  32.89 
 
 		 584 aa  270  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.69 
 
 		 598 aa  269  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.31 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  30.57 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  31.78 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.09 
 
 		 582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  34.89 
 
 		 568 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.69 
 
 		 574 aa  267  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.12 
 
 		 583 aa  267  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.24 
 
 		 579 aa  266  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  36.52 
 
 		 1138 aa  267  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  34.9 
 
 		 603 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  34.4 
 
 		 652 aa  266  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>