85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1874 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  223  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  39.73 
 
 		 74 aa  66.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  40.54 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  40.54 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  48.28 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  48.28 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  49.12 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  52.63 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  46.43 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  43.86 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  39.71 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  43.1 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  48.21 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  42.25 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  50.98 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  39.34 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  46.43 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.26 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  43.64 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  40.35 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  43.33 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  41.82 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  45.76 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  41.38 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  48.08 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  48.08 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  46.27 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  49.02 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  38.57 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  41.07 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  44.83 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  52.27 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  38.98 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  51.28 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  43.14 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  53.85 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  45.65 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  32.86 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  56.41 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  36.11 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2115  hypothetical protein  38.03 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.592477  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  35.53 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  38.46 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  41.27 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  46.55 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  38.3 
 
 		 72 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  47.17 
 
 		 64 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  35.09 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  47.92 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  32.47 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  33.78 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  39.22 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>