151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4913 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 		 273 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  84.44 
 
 		 274 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  84.93 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  84.93 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  64.44 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  63.33 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  70.74 
 
 		 271 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  70.74 
 
 		 271 aa  322  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  72.22 
 
 		 271 aa  311  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  59.41 
 
 		 275 aa  308  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  55.64 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  55.64 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  55.64 
 
 		 278 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  55.64 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  56.02 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  44.11 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  40.89 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  42.44 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  41.85 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  43.7 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  35.47 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  40.81 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  40.81 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  42.6 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  38.38 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  40.66 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  41.11 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 274 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  45.08 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  44.13 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  45.08 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  41.08 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  41.08 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  42.15 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 		 276 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  37.36 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  29.66 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  32.34 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  31.82 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  32.35 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  29.32 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  25.7 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  26.74 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  29.03 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  38.81 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  25.66 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  40.32 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  25.36 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  27.76 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  28.94 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  25.46 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.72 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.03 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.27 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  24.16 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  27.17 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  37.19 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  27.98 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  20.18 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  32.64 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  26.03 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  32.12 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  24.87 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  27.42 
 
 		 286 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  27.54 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.64 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  41.75 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1933  hypothetical protein  27.78 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  35.25 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.56 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.79 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  34.29 
 
 		 334 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>