More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1363 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  52.75 
 
 
790 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  41.76 
 
 
797 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  51.68 
 
 
780 aa  782    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
774 aa  1586    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  48.37 
 
 
761 aa  674    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  57.35 
 
 
765 aa  856    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  51.12 
 
 
763 aa  790    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  49.39 
 
 
759 aa  711    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  50.4 
 
 
789 aa  733    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  42.72 
 
 
747 aa  618  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  42.8 
 
 
759 aa  615  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  46.01 
 
 
767 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  43.69 
 
 
823 aa  552  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
774 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
756 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 
762 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  43.88 
 
 
411 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
386 aa  333  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  42.01 
 
 
391 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  37.44 
 
 
391 aa  302  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  43.12 
 
 
405 aa  299  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  37.9 
 
 
390 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  39.9 
 
 
395 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  38.7 
 
 
397 aa  279  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  42.54 
 
 
360 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  39.82 
 
 
337 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  38.53 
 
 
349 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  40.86 
 
 
353 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  39.47 
 
 
364 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
399 aa  220  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 
416 aa  217  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
399 aa  211  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 
371 aa  209  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  38.44 
 
 
378 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
393 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
392 aa  202  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  39.24 
 
 
371 aa  202  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
405 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
414 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
378 aa  196  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
388 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
393 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
393 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  36.71 
 
 
404 aa  187  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
393 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  34.96 
 
 
339 aa  172  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  36.44 
 
 
348 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  37.57 
 
 
340 aa  161  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  37.65 
 
 
338 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  34.68 
 
 
340 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  36.92 
 
 
351 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  33.82 
 
 
367 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
396 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.94 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
381 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.21 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  27.82 
 
 
395 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.41 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.07 
 
 
401 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
374 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  27.38 
 
 
395 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.84 
 
 
394 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
415 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.4 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
536 aa  72.8  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.77 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
404 aa  70.1  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
387 aa  69.7  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.56 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  21.55 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  23.37 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
402 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
370 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
378 aa  67  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 
413 aa  67  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.25 
 
 
404 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>