More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6547 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  96.53 
 
 		 346 aa  705    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 346 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  84.1 
 
 		 346 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  80.64 
 
 		 345 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  72.17 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  62.32 
 
 		 343 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  60.76 
 
 		 347 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  58.26 
 
 		 344 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  49.28 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  47.99 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  48.84 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  47.55 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  48.55 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  48.84 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  48.84 
 
 		 346 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  46.69 
 
 		 345 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  45.82 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  42.44 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  41.86 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  42.15 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  42.15 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.06 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 		 363 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.73 
 
 		 353 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.49 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.12 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.16 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.28 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  25 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.35 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  25.57 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.63 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.05 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  26.74 
 
 		 402 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.67 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.12 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  31.88 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  26.53 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  25.5 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  26.42 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  25.84 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.95 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  24.93 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  32.83 
 
 		 345 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  26.84 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  24.79 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 		 408 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  24.04 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  27.59 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.44 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  25 
 
 		 6889 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  24.05 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 		 1107 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  27.8 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  24.52 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  26.49 
 
 		 4483 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  23.28 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.37 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  24.93 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  24.93 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  24.93 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  23.08 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  28.64 
 
 		 382 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  24.25 
 
 		 384 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.88 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.1 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  25.64 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  24.25 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  28.04 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  32.17 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  26.33 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  24.14 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  30.32 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  24.13 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.22 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  31.14 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.2 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  25.29 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  28.51 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  26.61 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  26.24 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  27.6 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  27.17 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  25.57 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  23.71 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  23.71 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  28.66 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  24.3 
 
 		 3337 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  22.61 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  25.97 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  25.42 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>