More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4774 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 448 aa  910    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  82.37 
 
 		 448 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  46.09 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  41.93 
 
 		 448 aa  356  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  40.36 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  36.59 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 439 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 439 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  31.83 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 430 aa  230  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  33.07 
 
 		 387 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  30.93 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  26.78 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  26.54 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  27.29 
 
 		 482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 427 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  28.5 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  24.32 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  28.64 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.45 
 
 		 455 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 468 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 468 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  27.12 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  29.05 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 432 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  28.23 
 
 		 430 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  26 
 
 		 465 aa  96.3  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  26.96 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  26 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  26.12 
 
 		 470 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  26.89 
 
 		 466 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 462 aa  93.6  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  29.27 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 428 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  26.73 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 521 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 478 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  25.37 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 422 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>