More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4524 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  82.5 
 
 		 203 aa  313  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  44.21 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.93 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.39 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  29.35 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.62 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  34.19 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.36 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.28 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  26.84 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.91 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  35.56 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  40.43 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  36.47 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  23.44 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  35.92 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  36.84 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  34.67 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.37 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.35 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  40 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.37 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  26.8 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  36.67 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  35.85 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1182  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142459  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  29.76 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  41.27 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  26.8 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  36 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.39 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  29.76 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.34 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  31.58 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  31.58 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  31.58 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.14 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.37 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  38.46 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  34.09 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  31.58 
 
 		 269 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.78 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  30.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  30.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  30.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  30.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  31.91 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  30.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  30.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.49 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  26.29 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 252 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 252 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 252 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  25.93 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  38.46 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  30.48 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.74 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.16 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  33.33 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  31.71 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.39 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  27.37 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  24.24 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>