153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2654 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  89.06 
 
 		 128 aa  235  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  61.65 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  61.36 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  54.47 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  60 
 
 		 141 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.27 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  56.48 
 
 		 137 aa  129  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  52.5 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  33.59 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  40.98 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  36.72 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  41 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  31.82 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  32.82 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  32.82 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  32.33 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  31.85 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  37.3 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  37.3 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  37.3 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.05 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  32.63 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  35.94 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  35.48 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  35.16 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.28 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  33.87 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  36.26 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.36 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  37.36 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  33.64 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  32.71 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4002  cupin 2 protein  34.65 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.17 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0588  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00966189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  29.9 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  32.63 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.46 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  29.47 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.68 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.6 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  33.91 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  45 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  45.28 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  37.5 
 
 		 318 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.82 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  35.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  31.52 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  37.5 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  29.84 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  29.09 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.3 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  38.98 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.36 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  38.98 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  32.97 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0831  hypothetical protein  34.74 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  37.88 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  32.56 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.23 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.18 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 206 aa  42.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  26.09 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>