More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2156 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  99.02 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  92.2 
 
 		 205 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1514  30S ribosomal protein S4  91.22 
 
 		 205 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  84.88 
 
 		 205 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  84.88 
 
 		 205 aa  364  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  83.41 
 
 		 206 aa  362  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  84.39 
 
 		 205 aa  362  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  82.93 
 
 		 206 aa  359  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  82.93 
 
 		 206 aa  359  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  84.88 
 
 		 206 aa  359  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  82.93 
 
 		 205 aa  358  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  82.44 
 
 		 206 aa  355  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  80.98 
 
 		 205 aa  353  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  79.02 
 
 		 206 aa  348  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  79.02 
 
 		 206 aa  345  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  77.56 
 
 		 205 aa  343  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  78.05 
 
 		 205 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  76.59 
 
 		 205 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  77.07 
 
 		 205 aa  339  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  76.59 
 
 		 205 aa  337  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  75.61 
 
 		 205 aa  333  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  78.05 
 
 		 206 aa  333  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  74.63 
 
 		 205 aa  332  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  74.63 
 
 		 205 aa  330  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  75.12 
 
 		 205 aa  328  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  75.98 
 
 		 205 aa  328  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  73.17 
 
 		 205 aa  325  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  75.12 
 
 		 205 aa  325  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  75.61 
 
 		 205 aa  324  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  76.1 
 
 		 205 aa  324  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  75.12 
 
 		 205 aa  324  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  75.12 
 
 		 205 aa  324  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  75.12 
 
 		 205 aa  320  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  73.04 
 
 		 205 aa  320  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0786  30S ribosomal protein S4  70.73 
 
 		 203 aa  308  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  0.376942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1140  30S ribosomal protein S4  70.24 
 
 		 204 aa  306  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.768431  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  72.2 
 
 		 204 aa  305  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2245  30S ribosomal protein S4  67.32 
 
 		 203 aa  298  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  71.22 
 
 		 205 aa  297  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0701  30S ribosomal protein S4  64.88 
 
 		 204 aa  287  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5891  RNA-binding S4 domain protein  80.29 
 
 		 146 aa  230  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0912  30S ribosomal protein S4  50.51 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0194  30S ribosomal protein S4  49.49 
 
 		 202 aa  206  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0388  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0583  ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 200 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0274  30S ribosomal protein S4  45.24 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0146675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  44.88 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  46.12 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  45.24 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.19 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  43.41 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  45.71 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0339  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.411098  normal  0.0560525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  46.01 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  44.81 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  46.01 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  44.81 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3619  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00390122  hitchhiker  0.00000000725029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  43.41 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3924  30S ribosomal protein S4  47.62 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>