More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5780 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
548 aa  1126    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  97.26 
 
 
548 aa  1082    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  51.84 
 
 
551 aa  595  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  47.09 
 
 
557 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  44.81 
 
 
556 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  42.99 
 
 
560 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  43.18 
 
 
560 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  37.94 
 
 
545 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  34.14 
 
 
627 aa  316  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 
597 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  35.12 
 
 
557 aa  297  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 
559 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  32.89 
 
 
567 aa  279  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 
540 aa  274  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  33.86 
 
 
567 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  30.97 
 
 
562 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
552 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  32.5 
 
 
554 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 
565 aa  250  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.6 
 
 
551 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  31.15 
 
 
561 aa  236  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 
569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 
553 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  30.89 
 
 
579 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 
547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 
559 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  29.34 
 
 
576 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 
636 aa  207  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
557 aa  208  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
557 aa  206  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  29.81 
 
 
572 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
560 aa  190  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  30.14 
 
 
560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 
580 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.76 
 
 
563 aa  180  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 
609 aa  177  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 
587 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.17 
 
 
564 aa  170  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 
565 aa  163  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
604 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
576 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
604 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.07 
 
 
563 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  28.27 
 
 
562 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 
568 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.07 
 
 
588 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
559 aa  133  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.86 
 
 
542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  28.6 
 
 
540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
544 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 
534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.04 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
552 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.19 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.31 
 
 
520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.81 
 
 
524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.81 
 
 
546 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
510 aa  126  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.67 
 
 
577 aa  125  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
540 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.28 
 
 
609 aa  124  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 
533 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 
533 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 
539 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.17 
 
 
542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 
645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 
645 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.58 
 
 
531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 
516 aa  117  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
512 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.46 
 
 
522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 
529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 
592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.83 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 
579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
531 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  27.54 
 
 
605 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.35 
 
 
537 aa  113  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.23 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.55 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  26.85 
 
 
518 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.21 
 
 
542 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.64 
 
 
532 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
543 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  28.81 
 
 
541 aa  110  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
537 aa  110  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>