More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5221 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  83.01 
 
 
259 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  74.9 
 
 
256 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  71.37 
 
 
256 aa  374  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
267 aa  353  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  65.48 
 
 
258 aa  340  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  64.59 
 
 
263 aa  338  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  62.31 
 
 
260 aa  333  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  63.82 
 
 
256 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  63.04 
 
 
273 aa  329  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  61.81 
 
 
260 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  63.6 
 
 
252 aa  325  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  62.55 
 
 
254 aa  324  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.2 
 
 
254 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  62.8 
 
 
254 aa  322  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  64.29 
 
 
254 aa  322  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  62.4 
 
 
250 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  62.35 
 
 
254 aa  321  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  61.6 
 
 
250 aa  321  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  62.8 
 
 
267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  63.16 
 
 
255 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  59.44 
 
 
261 aa  316  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  60.87 
 
 
254 aa  315  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  63.31 
 
 
254 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  61 
 
 
276 aa  315  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  62.3 
 
 
256 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  58.3 
 
 
263 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  60.92 
 
 
262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  60.94 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  60.4 
 
 
268 aa  308  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.2 
 
 
244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.2 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.66 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  59.77 
 
 
264 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  59.51 
 
 
264 aa  304  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  58 
 
 
255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  59.76 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  59.16 
 
 
274 aa  301  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58 
 
 
239 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.71 
 
 
567 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  59.06 
 
 
274 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  60 
 
 
274 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  57.09 
 
 
254 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.13 
 
 
240 aa  299  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 
254 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  61.07 
 
 
279 aa  299  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  58.8 
 
 
244 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.43 
 
 
256 aa  298  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  59.2 
 
 
263 aa  297  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54.58 
 
 
289 aa  296  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.82 
 
 
592 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  59.61 
 
 
262 aa  296  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  55.78 
 
 
289 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  56.18 
 
 
288 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.51 
 
 
602 aa  295  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  59.35 
 
 
253 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  56.97 
 
 
254 aa  294  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 
275 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.4 
 
 
240 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.2 
 
 
244 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  57.14 
 
 
245 aa  292  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.73 
 
 
567 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.8 
 
 
244 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.11 
 
 
268 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
299 aa  290  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 
594 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.8 
 
 
242 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 
594 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56 
 
 
240 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.34 
 
 
244 aa  289  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.8 
 
 
240 aa  289  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  58.57 
 
 
256 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.36 
 
 
246 aa  288  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.05 
 
 
252 aa  288  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  57.66 
 
 
243 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  58.94 
 
 
256 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  53.1 
 
 
253 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.61 
 
 
636 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.13 
 
 
636 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  58.61 
 
 
636 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.03 
 
 
597 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  58.61 
 
 
636 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.61 
 
 
636 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
240 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.13 
 
 
636 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.2 
 
 
246 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  57.96 
 
 
243 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.57 
 
 
244 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.03 
 
 
249 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  54.98 
 
 
267 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.37 
 
 
253 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  56.4 
 
 
241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.6 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.4 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.63 
 
 
619 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 
598 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.2 
 
 
242 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.4 
 
 
242 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.52 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  55.6 
 
 
243 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>