More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1373 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  44.25 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  50.67 
 
 		 247 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  50.22 
 
 		 247 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  49.78 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  53 
 
 		 249 aa  215  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  49.75 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  49.26 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  49.26 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  48.1 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  48.76 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  47.55 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  46.76 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  47.55 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  48.53 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  49.03 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  47.34 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  47.74 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  47.32 
 
 		 250 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  41.22 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  48.04 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  46.57 
 
 		 252 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  43.33 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  46.19 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  47.55 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  48.73 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  42.5 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  43.33 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  47.15 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  43.33 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  43.89 
 
 		 259 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  43.33 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  43.29 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  43.04 
 
 		 263 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  41.41 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  42.08 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  46.46 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  42.99 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  39.09 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  38.53 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  46.39 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  42.71 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  43.54 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  40.64 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  46.6 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  38.19 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  40.1 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  44.51 
 
 		 235 aa  150  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  41.7 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  40 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  39.63 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  41.4 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  39.34 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  40.19 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  40.19 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  40 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1525  signal peptidase I  36.84 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1516  signal peptidase I  36.44 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  37.67 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  39.5 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  39.5 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  39.49 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  37.04 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  38.84 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  37.22 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.86 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  36.36 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  38.39 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  37.31 
 
 		 256 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.24 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  36.4 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  36.84 
 
 		 253 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  36.79 
 
 		 263 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  36.79 
 
 		 263 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  33.47 
 
 		 278 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  33.9 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  34.4 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  36.13 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  35.66 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  38.78 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  33.76 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  34.03 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  36.02 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  34.56 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  35.06 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  36.05 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  40.32 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  33.33 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  35.24 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.52 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  36.04 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  35.93 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  35.47 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  33.91 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>