157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5503 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 		 337 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  67.58 
 
 		 334 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  65.05 
 
 		 341 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  67.78 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  66.06 
 
 		 334 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  56.63 
 
 		 342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.63 
 
 		 629 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  48.52 
 
 		 339 aa  331  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  49.11 
 
 		 361 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  50 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  49.24 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  31.66 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.43 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.55 
 
 		 350 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  34.74 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  37.93 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.23 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  32.29 
 
 		 358 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.48 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  33.2 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30.72 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.57 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.49 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.4 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.32 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  30.66 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.27 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  29.28 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  31.8 
 
 		 297 aa  89.7  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.63 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.86 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.9 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.48 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.25 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  28.28 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  25.25 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23.97 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25.82 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  28.1 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  22.38 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  28.45 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  32.34 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  20.9 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  22.68 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  20.9 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.81 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  29.11 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  24.04 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  22.74 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  27.09 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  31.47 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.2 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.28 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  23.55 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 426 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 426 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 418 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.99 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>