More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5277 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  84.11 
 
 		 330 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  74.69 
 
 		 323 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  74.01 
 
 		 326 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  50.16 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  48.29 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  49.67 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  47.37 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  47.02 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  47.65 
 
 		 319 aa  291  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  48.32 
 
 		 338 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  45.64 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  48.68 
 
 		 325 aa  288  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  47.33 
 
 		 324 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  47.35 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.11 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.52 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  47.46 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.29 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  46.76 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.57 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  47 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 		 332 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  39.18 
 
 		 325 aa  245  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.95 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.48 
 
 		 331 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  43.27 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.86 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.52 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.82 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.3 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.94 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  42.95 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.29 
 
 		 330 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  43.61 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  42.27 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.62 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.94 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  44.63 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  41.18 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  42.62 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.19 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  40.92 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.19 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  42.86 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.42 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  43 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  40.81 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.22 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  41.51 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.58 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.75 
 
 		 332 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.39 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  43.62 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  38.79 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.5 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.46 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.59 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  40.26 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43.29 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.58 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.88 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  41.45 
 
 		 338 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.82 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  41.4 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  40.75 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  42.11 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  39.26 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.32 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.43 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.53 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.69 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.6 
 
 		 328 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.2 
 
 		 322 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.12 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  39.02 
 
 		 333 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.94 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  40 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.67 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.87 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.67 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.87 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  41.28 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  40.63 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.47 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  41.39 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.45 
 
 		 351 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.14 
 
 		 328 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  43.95 
 
 		 356 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>