More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4874 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 161 aa  333  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  49.68 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  47.4 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 174 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 168 aa  84  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  29.92 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  36.26 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  23.61 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  25 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  30.83 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  25.38 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>