193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3458 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 145 aa  289  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  56.3 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  50.76 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  56.3 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  54.76 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  35.34 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  35.07 
 
 		 185 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  36.15 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  34.35 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  38.71 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  37.4 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  36.45 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  33.08 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  39.13 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  36.52 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  29.32 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  36.61 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  39.13 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  39.13 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.23 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  41.57 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  41.18 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  40.59 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.61 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  35.09 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.62 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  31.78 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  32.32 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  44.29 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.48 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  35.48 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  36.99 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  32.56 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.35 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  30.36 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 204 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 182 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  25.66 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  31.37 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  37.11 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  31.37 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.79 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  32.52 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.37 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  34.07 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.08 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.39 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>