195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1837 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1837  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  58.82 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  33.57 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.76 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  37.39 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  32.69 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  39.52 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  37.9 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  34.75 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  37.1 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  32.67 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  35.25 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  34.78 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  27.78 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  38.53 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  29.75 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  29.75 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  29.75 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  36.67 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  36.67 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  32.81 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  30.83 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  29.01 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  34.11 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  36.72 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  41.94 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  28.06 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.83 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  28.93 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  28.93 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  28.93 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  26.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  26.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  28.93 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  26.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  38 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  30.89 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  28.93 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  36.29 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  29.41 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  34.17 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  31.36 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 213 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  30.65 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  31.9 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  38.75 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  34.58 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>