92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1153 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  57.53 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  49.73 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  49.73 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  56.22 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  49.73 
 
 		 217 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  49.73 
 
 		 217 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  49.73 
 
 		 217 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  49.73 
 
 		 217 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  49.73 
 
 		 217 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  50.54 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  45.92 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  47.87 
 
 		 217 aa  178  9e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  49.73 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  51.87 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  51.87 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  49.73 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  48.66 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  51.63 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  46.2 
 
 		 222 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  47.28 
 
 		 222 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  49.47 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  46.03 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  42.39 
 
 		 218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  51.63 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  36.02 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  42.7 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  37.97 
 
 		 193 aa  125  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  34.33 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  33.33 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  34.57 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  34.34 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32.38 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  29.84 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.44 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  32.02 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  30.39 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30.85 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.88 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.53 
 
 		 382 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  26.9 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  31.98 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.26 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.42 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  28.57 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  28.57 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.44 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  27.92 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  23.66 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.95 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  31.86 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  24.3 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  31.55 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  29.94 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  23.71 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  27.36 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  26.24 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  24.22 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  25.76 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  28.16 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.59 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  24.77 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  26.32 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  26.37 
 
 		 356 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  24.56 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  27.43 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.14 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  24.02 
 
 		 357 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  29.19 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  28.82 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  25.81 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  25.27 
 
 		 192 aa  45.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.44 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  25.22 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.33 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  24.6 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  23.87 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  23.29 
 
 		 471 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  43.48 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  31.37 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.48 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.78 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.26 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  30.11 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  22.38 
 
 		 475 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.68 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  25.98 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  27.37 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>