133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1275 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 169 aa  325  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  62.72 
 
 		 164 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  36.46 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  35.83 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  47.19 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  35.66 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  33.14 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  31.63 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.3 
 
 		 92 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  53.97 
 
 		 86 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  50.88 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  45.95 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  45.95 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  43.55 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  50.77 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  57.14 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  29.7 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  49.21 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  32.38 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 847 aa  58.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 		 466 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  53.57 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  54.72 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  28.92 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  53.45 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  30.81 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  27.39 
 
 		 578 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  56.36 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  47.37 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  50.82 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 58 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  28.97 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  35.63 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 481 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 458 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  47.62 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 394 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  41.82 
 
 		 240 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  31.25 
 
 		 419 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  40 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 64 aa  51.6  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 81 aa  51.6  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  46.43 
 
 		 81 aa  51.2  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 84 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 62 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 400 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 77 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  40.68 
 
 		 515 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  51.67 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 59 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  51.85 
 
 		 547 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  38.71 
 
 		 582 aa  48.5  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  55.07 
 
 		 421 aa  48.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  38.6 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.9 
 
 		 427 aa  48.5  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 419 aa  48.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 394 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  47.8  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 68 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  48.15 
 
 		 512 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 76 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  50 
 
 		 445 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  36.11 
 
 		 119 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  54 
 
 		 533 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  38.57 
 
 		 452 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 474 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.24 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 96 aa  45.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 416 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  42.03 
 
 		 399 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  41.98 
 
 		 417 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 82 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 61 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  36.21 
 
 		 61 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 		 61 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  44.44 
 
 		 70 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05619  PspC domain superfamily  45.83 
 
 		 52 aa  44.7  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0146785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>