223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2901 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2901  putative permease  100 
 
 		 364 aa  712    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  99.73 
 
 		 364 aa  710    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  91.21 
 
 		 364 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  53.28 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  50.55 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  51.21 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  49.59 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  38.57 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  36.04 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  36.44 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  36.31 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  36.59 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  34.99 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  33.33 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  32.04 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  33.7 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  32.23 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  33.51 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  32.52 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  35.99 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  33.51 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  35.87 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  36.99 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  35.33 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  35.33 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  32.42 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  30.6 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  30.87 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  30.25 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  31.99 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  28.3 
 
 		 363 aa  155  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  30.22 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  29.75 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  29.7 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.93 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  26.5 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.16 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  28.01 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.13 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  28.01 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  24.71 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  26.49 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  27.7 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  26.55 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  25.42 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  26.14 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  25.99 
 
 		 356 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  29.01 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  26.29 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  27.98 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  27.2 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  26 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  26.91 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  29.32 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  25.61 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  25.61 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  24.81 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  21.6 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  24.3 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.2 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  26.36 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  28.41 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  20.98 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  25.29 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  25.39 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  25.47 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  25.83 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  26.15 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  27.43 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  27.08 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.71 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  26.11 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  25.56 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>