111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4222 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4222  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 254 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.550673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4327  TPR repeat-containing protein  79.72 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  65.99 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4397  tetratricopeptide TPR_2  58.68 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0942  hypothetical protein  58.48 
 
 		 238 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44 
 
 		 818 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.48 
 
 		 1056 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.65 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.67 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.77 
 
 		 988 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 178 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.59 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 556 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  33.64 
 
 		 385 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  43.21 
 
 		 421 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.58 
 
 		 746 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.19 
 
 		 778 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2357  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 425 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.72 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.72 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  47.46 
 
 		 339 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 4489 aa  48.9  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.08 
 
 		 706 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 707 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  44.62 
 
 		 413 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 628 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 750 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 649 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  40.3 
 
 		 463 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 361 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  39.44 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 		 442 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 284 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  43.75 
 
 		 497 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.08 
 
 		 542 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1421 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.99 
 
 		 820 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 750 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 3560 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.85 
 
 		 839 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 935 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  34.88 
 
 		 612 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.23 
 
 		 528 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  26.14 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.66 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 617 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.13 
 
 		 582 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  28.12 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  57.58 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 1276 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 621 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  34.38 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.94 
 
 		 541 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 573 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  34.92 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  32.14 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.66 
 
 		 706 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 589 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  35.62 
 
 		 695 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 574 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  34.92 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  39.66 
 
 		 668 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 562 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  39.39 
 
 		 518 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3839  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 326 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 593 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 450 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 1737 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.8 
 
 		 343 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  35.21 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  32.73 
 
 		 128 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 152 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 319 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.54 
 
 		 406 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>