181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2805 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  85.1 
 
 		 231 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  80.77 
 
 		 208 aa  340  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  59.62 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  62.98 
 
 		 208 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  35.71 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  35.71 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  35.71 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  33.51 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  33.51 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  34.03 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  34.03 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  33.51 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  33.51 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  34.21 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  33.51 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  36.26 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  33.51 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  33.84 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  33.33 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  33.33 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  35.71 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  33.33 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  33.33 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  35.16 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  33.52 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.8 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  36.02 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.47 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  28.04 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.14 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.63 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.15 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  25.91 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  25.74 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.48 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  27.6 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.41 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  30.92 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.45 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  28.3 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.81 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.91 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.64 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3272  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  34.57 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  21.94 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  35 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  39.71 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  37.18 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.31 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.09 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  31.37 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  29.06 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  24.64 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.87 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  35.71 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.14 
 
 		 240 aa  51.6  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0669  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0965  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3582  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.548756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  29.94 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  25.49 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  27.45 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  31.94 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  28.95 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.03 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3587  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.35 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  35.9 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>