More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1961 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  88.67 
 
 		 825 aa  1476    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  56.79 
 
 		 743 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  45.47 
 
 		 821 aa  704    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 803 aa  1642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  57.18 
 
 		 746 aa  815    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  52.23 
 
 		 800 aa  809    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  39.73 
 
 		 844 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  40.35 
 
 		 825 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 		 828 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  37.97 
 
 		 828 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  38.08 
 
 		 841 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  38.29 
 
 		 841 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  37.29 
 
 		 826 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  37.42 
 
 		 830 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 840 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  37.62 
 
 		 824 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  38.34 
 
 		 826 aa  486  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  36.85 
 
 		 809 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  37.3 
 
 		 815 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 		 841 aa  452  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  36.28 
 
 		 836 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  37.23 
 
 		 864 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  35.66 
 
 		 812 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  35.88 
 
 		 807 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  35.08 
 
 		 810 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  36.52 
 
 		 799 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  35.59 
 
 		 819 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  38.27 
 
 		 713 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  37.34 
 
 		 720 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 		 722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 		 738 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 		 738 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 		 717 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  37.05 
 
 		 727 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  36.5 
 
 		 722 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 816 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 814 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  37.26 
 
 		 752 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.37 
 
 		 802 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  37.11 
 
 		 719 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  37.11 
 
 		 747 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  34.46 
 
 		 812 aa  396  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 822 aa  392  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  37.11 
 
 		 719 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 745 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 		 827 aa  392  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  35.31 
 
 		 831 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 703 aa  389  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  33.5 
 
 		 801 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 		 841 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  32.28 
 
 		 808 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 817 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  35.91 
 
 		 724 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 803 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 806 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  32.83 
 
 		 802 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.33 
 
 		 789 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 		 803 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 795 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 		 822 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  33.5 
 
 		 798 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  35.99 
 
 		 766 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  35.42 
 
 		 753 aa  360  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 723 aa  360  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 787 aa  357  6.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 		 753 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 833 aa  343  8e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 741 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 747 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 747 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  34.57 
 
 		 699 aa  332  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  35.81 
 
 		 723 aa  330  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  33.44 
 
 		 720 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 693 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  32.89 
 
 		 744 aa  329  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 693 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 696 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 741 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 737 aa  323  7e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 748 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 765 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  33.99 
 
 		 719 aa  318  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 840 aa  316  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 725 aa  316  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 		 778 aa  315  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 732 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 		 714 aa  314  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.05 
 
 		 728 aa  313  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 735 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 729 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 729 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 729 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  31.51 
 
 		 729 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.21 
 
 		 729 aa  307  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 729 aa  306  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.37 
 
 		 729 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>