More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0569 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  96.83 
 
 		 725 aa  1432    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  98.34 
 
 		 725 aa  1430    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  50.76 
 
 		 719 aa  687    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  92.68 
 
 		 724 aa  1385    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 724 aa  1476    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.71 
 
 		 812 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 840 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  33.1 
 
 		 802 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 722 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  31.91 
 
 		 815 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 824 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 802 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 825 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 717 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  31.28 
 
 		 810 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 828 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 817 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 719 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 819 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 787 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 841 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 724 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 722 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 800 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 826 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 828 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 841 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 841 aa  311  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  31.49 
 
 		 713 aa  311  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 724 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  31.29 
 
 		 720 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 703 aa  308  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 738 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 738 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  31.44 
 
 		 799 aa  306  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 745 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 727 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  31.62 
 
 		 807 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 806 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 844 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  29.97 
 
 		 747 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  31.8 
 
 		 808 aa  304  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 831 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 822 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 803 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  31.35 
 
 		 812 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 795 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  29.97 
 
 		 719 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  29.97 
 
 		 752 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  29.97 
 
 		 719 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 830 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 798 aa  296  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 809 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 814 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 827 aa  293  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 803 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.45 
 
 		 825 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 746 aa  288  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.48 
 
 		 743 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 826 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  31.02 
 
 		 766 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 816 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.58 
 
 		 747 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  27.31 
 
 		 744 aa  278  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 822 aa  278  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 864 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 836 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 735 aa  273  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.33 
 
 		 728 aa  273  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.85 
 
 		 789 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.78 
 
 		 729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.78 
 
 		 729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.78 
 
 		 729 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.78 
 
 		 729 aa  271  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.78 
 
 		 729 aa  271  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  27.78 
 
 		 729 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 821 aa  271  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 729 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.51 
 
 		 729 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 731 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 803 aa  266  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 765 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.65 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.98 
 
 		 724 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.98 
 
 		 724 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.98 
 
 		 724 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 729 aa  263  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 833 aa  263  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 722 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.84 
 
 		 724 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 723 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 841 aa  262  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 801 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 765 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 722 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 765 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.84 
 
 		 724 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 722 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 733 aa  256  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>