More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4679 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.79 
 
 		 644 aa  1097    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.724579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.88 
 
 		 677 aa  1113    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.1 
 
 		 644 aa  1099    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4936  methyl-accepting chemotaxis protein  76.09 
 
 		 644 aa  918    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0578  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  76.86 
 
 		 644 aa  888    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.74 
 
 		 644 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.939585  hitchhiker  0.000667074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0529  chemotaxis sensory transducer  78.73 
 
 		 673 aa  933    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 644 aa  1251    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  38.9 
 
 		 545 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 		 637 aa  180  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  38.15 
 
 		 559 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.17 
 
 		 544 aa  177  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 638 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 		 658 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 666 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  33.89 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  38.48 
 
 		 545 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  39.37 
 
 		 630 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  33.51 
 
 		 549 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 554 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  38.98 
 
 		 545 aa  167  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  35.45 
 
 		 554 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 558 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  35.2 
 
 		 553 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 713 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 630 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 630 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 552 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 630 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  32.7 
 
 		 634 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 702 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 554 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  36.96 
 
 		 557 aa  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.68 
 
 		 630 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 		 630 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 		 630 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 		 630 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 		 667 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 		 497 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 573 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 		 667 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 667 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 637 aa  162  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 		 540 aa  161  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 		 548 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 		 667 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  37.29 
 
 		 712 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 		 665 aa  160  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 667 aa  160  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 		 554 aa  160  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 		 560 aa  160  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 554 aa  160  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  34.25 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.11 
 
 		 627 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  37.29 
 
 		 712 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 714 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 		 674 aa  158  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  34.63 
 
 		 639 aa  158  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.44 
 
 		 630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 		 554 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  33.68 
 
 		 546 aa  157  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.33 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.39 
 
 		 650 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.13 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 		 702 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 554 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 554 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 554 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.63 
 
 		 554 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  37.11 
 
 		 578 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2823  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.03 
 
 		 550 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.35 
 
 		 554 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  34.19 
 
 		 549 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 495 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 539 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0243326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.48 
 
 		 626 aa  154  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 541 aa  154  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.58 
 
 		 554 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  37 
 
 		 714 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37 
 
 		 714 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>