221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3341 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  100 
 
 		 437 aa  886    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  47.26 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  44.62 
 
 		 446 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  43.25 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  45.25 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  42.24 
 
 		 444 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  44.39 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  42.4 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  39.77 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  42.33 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  42.96 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  40.04 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  42.37 
 
 		 439 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  41.15 
 
 		 457 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  40.19 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  41.67 
 
 		 445 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  40.45 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  40.72 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  41.56 
 
 		 447 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  42.13 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  41.96 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  41.8 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  39.52 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  37.42 
 
 		 421 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  37.86 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  38.85 
 
 		 442 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  38.74 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  37.06 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  38.26 
 
 		 450 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  38.14 
 
 		 410 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  38.37 
 
 		 421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  37.47 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  36.05 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  35.63 
 
 		 421 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  37 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  37.24 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  36.87 
 
 		 417 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  35.62 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  35.45 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  36.41 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  36.7 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  35.45 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  35.21 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  37.01 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  36.3 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  35.83 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  36.51 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  37.23 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  36.52 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  35.14 
 
 		 430 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  35.85 
 
 		 431 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  35.32 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  34.2 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  36.08 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  33.48 
 
 		 420 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  35.25 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  33.64 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  33.96 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  32.82 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  36.38 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  34.61 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  35.38 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  36.14 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  33.63 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  33.04 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  32.82 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  36.15 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  36.15 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  33.71 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32.88 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  33.33 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  33.18 
 
 		 408 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  33.64 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  33.82 
 
 		 415 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  33.78 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  34.54 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  33.72 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  34.06 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  33.72 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  35.96 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  32.88 
 
 		 409 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  34.56 
 
 		 440 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  33.49 
 
 		 417 aa  200  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  33.41 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  32.88 
 
 		 409 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  31.83 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  32.51 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  33.56 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  33.73 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  33.1 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  35.03 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  32.35 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  31.98 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  33.87 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  31.9 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  30.72 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  31.44 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  32.41 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  33.26 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  33.89 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>