222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5318 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  100 
 
 		 448 aa  915    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  94.87 
 
 		 448 aa  871    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  67.93 
 
 		 442 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  65.4 
 
 		 443 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  65.33 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  64.46 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  55.13 
 
 		 450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  49.34 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  50.33 
 
 		 439 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  46.51 
 
 		 440 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  47.1 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  46.5 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  44.47 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  46.17 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  45.15 
 
 		 457 aa  352  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  43.02 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  44.72 
 
 		 439 aa  349  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  45.24 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  43.96 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  43.08 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  42.4 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  40.13 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  40.69 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  41.67 
 
 		 443 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  39.68 
 
 		 437 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  36.96 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  37.24 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  36.73 
 
 		 421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  36.93 
 
 		 427 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  37.81 
 
 		 429 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  36.18 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  38.01 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  37.78 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  37.78 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  35.68 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  37.1 
 
 		 422 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  36.87 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  36.32 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  34.14 
 
 		 416 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  36.55 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  36.41 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  35.71 
 
 		 417 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  35.38 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  36.01 
 
 		 418 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  35.11 
 
 		 416 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  34.46 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  34.38 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  35.55 
 
 		 418 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  34.08 
 
 		 421 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  33.26 
 
 		 420 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  33.18 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  32.9 
 
 		 420 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  32.96 
 
 		 429 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  33.85 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  35.56 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  33.85 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  35.2 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  35.33 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  35.33 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  33.77 
 
 		 415 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  34.95 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  32.75 
 
 		 416 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  32.2 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  33.12 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  32.43 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  32.43 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  32.05 
 
 		 431 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  30.89 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  34.89 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  33.92 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  34.83 
 
 		 418 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  32.43 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  31.4 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  33.25 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  34.61 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  32.35 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  31.38 
 
 		 405 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  33.55 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  34.61 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  32.37 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  33.85 
 
 		 417 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  33.94 
 
 		 412 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  33.63 
 
 		 417 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  33.85 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  34.45 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  32.78 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  32.29 
 
 		 430 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  32.6 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  33.55 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  33.71 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  33.26 
 
 		 416 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  33.71 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  33.26 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  33.71 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  30.46 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  32.04 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  32.67 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  33.79 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  33.26 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  31.88 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>