221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2927 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  100 
 
 		 443 aa  914    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  55.15 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  55.46 
 
 		 460 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  53.79 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  51.44 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  52 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  50.94 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  47.31 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  44.62 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  45.56 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  46.06 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  44.19 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  43.27 
 
 		 443 aa  355  7.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  44.68 
 
 		 439 aa  352  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  45.37 
 
 		 456 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  44.11 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  44.87 
 
 		 441 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  44.94 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  43.44 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  44.39 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  43.44 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  41.36 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  40 
 
 		 421 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  41.41 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  40.45 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  40.45 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  40.65 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  41.09 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  41.71 
 
 		 448 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  39.37 
 
 		 418 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  39.47 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  40.24 
 
 		 429 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  40 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  39.76 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  38.8 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  38.58 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  40.22 
 
 		 422 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  40.04 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  38.86 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  39.41 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  37.39 
 
 		 427 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  37.56 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  35.91 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  37.08 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  38.15 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  36.64 
 
 		 411 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  36.85 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  36.49 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  36.71 
 
 		 429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  38.51 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  37.15 
 
 		 423 aa  259  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  36.04 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.1 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  36.04 
 
 		 412 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.1 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  38.06 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  36.3 
 
 		 418 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  39.19 
 
 		 418 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  36.53 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  38.95 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  35.83 
 
 		 431 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  36.3 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  36.34 
 
 		 416 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  35.83 
 
 		 431 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  35.59 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  37.29 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  36.14 
 
 		 408 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  36.34 
 
 		 417 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  36.9 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  35.36 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  34.97 
 
 		 424 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  36.9 
 
 		 410 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  35.29 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  35.76 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  36.49 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  34.34 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  35.23 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  35.7 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  36.07 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  36.3 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  35.7 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  35.08 
 
 		 415 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  34.92 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  36.24 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  36.52 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  36.15 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  34.2 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  36.1 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  35.76 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  35.09 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  35.53 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  36.1 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  36.1 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  34.45 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  36.02 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  37.38 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  35.48 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  36.67 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  36.61 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  34.02 
 
 		 410 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>